PAF Grant Maclean

PAF Awards $50,000 Nuova borsa di ricerca

Ken Maclean, Dottorato di Ricerca, Università del Colorado Denver

“Trattamento di chaperone chimico per ripristinare l'attività degli enzimi nelle mutazioni pieghevoli della carbossilasi propionil-Co-A: Verso una strategia terapeutica personalizzata nell'acidemia propionica (PA)" - In estate 2020, PAF assegnato un $50,000 concedere.”

Propionico acidemia (PA) è una grave malattia potenzialmente letale per la quale attualmente non esiste un trattamento veramente efficace. La malattia è causata dalla mutazione in uno dei due geni che codificano per l'enzima propionil-carbossilasi CoA (PCC). Questo enzima è composto da due diverse proteine ​​che si piegano l'una attorno all'altra in una struttura complessa con sei di ciascuna di queste due molecole. Questa è una struttura molto insolita e complessa per un enzima metabolico e un recente lavoro nel nostro laboratorio ha scoperto che una serie di mutazioni specifiche che causano PA causano problemi interferendo con il processo di ripiegamento e / o assemblaggio delle proteine ​​che porta a un enzima non funzionale e quindi la malattia. Nelle cellule, le proteine ​​con complicati schemi di piegatura sono spesso assistite nel loro ripiegamento da altre proteine ​​chiamate chaperone. Abbiamo osservato che un certo numero di forme mutanti di PCC possono essere ripristinate alla normale attività se sono aiutate a piegare correttamente usando queste proteine ​​chaperone. Nel nostro studio, esamineremo una serie di sostanze chimiche che possono anche fungere da accompagnatori e aiutare con il ripiegamento delle proteine ​​al fine di ripristinare la piena attività nelle forme mutanti di PCC. Questo lavoro si svolgerà inizialmente in un sistema di espressione di PCC batterico per identificare composti promettenti e quindi in base ai progressi, passare al trattamento delle cellule derivate da pazienti PCC umani. Questi studi hanno il potenziale per servire come primo passo iniziale nella progettazione razionale di una strategia medica personalizzata per pazienti con mutazioni specifiche che causano PA.

Sintesi della ricerca PAF Elango

PAF Awards $44,253 Nuova borsa di ricerca

Rajavel Elango, Dottorato di Ricerca, Università della Columbia Britannica

“Ottimizzare gli aminoacidi negli alimenti medici per gestire l'acidemia propionica "

Acidemia propionico (PA) è principalmente causato da un difetto enzimatico, propionyl-CoA carboxylase (PCC), nella via catabolica della valina, isoleucina e altri precursori propiogenici. La gestione dietetica della PA dipende principalmente dalla restrizione proteica dal cibo per ridurre l'apporto di aminoacidi propiogenici, e l'uso di alimenti medici speciali. Questi alimenti medici contengono tutti gli amminoacidi e i nutrienti essenziali, ma nessun composto propiogenico. Recentemente, sono state sollevate preoccupazioni riguardo al loro uso, a causa del contenuto sbilanciato degli aminoacidi a catena ramificata (BCAA) – alto contenuto di leucina, a minima o nessuna valina e isoleucina. La miscela squilibrata di BCAA influisce negativamente sulle concentrazioni plasmatiche di valina e isoleucina, ed è stato proposto di influenzare la crescita nei pazienti pediatrici con PA.

In uno studio retrospettivo di storia naturale in corso (n = 4), pazienti con PA trattati nel nostro centro dalla nascita (o diagnosi) a 18 anni, abbiamo osservato che una maggiore assunzione di cibo medico (rispetto alle proteine ​​intatte) si traduce in punteggi Z ht-for-age più bassi. Sulla base di questi dati pilota, proponiamo che sia immediatamente necessario determinare le quantità ottimali di leucina presenti negli alimenti medici.

Dunque, gli obiettivi specifici del presente studio sono:

  1. Studi di isotopi stabili
    1. Determinare il rapporto ideale tra BCAA nei bambini usando il metodo di amminoacido indicatore basato su isotopo stabile per ottimizzare la sintesi proteica in un approccio a prova di principio.
    2. Testare il rapporto tra BCAA usando lo stesso metodo stabile basato sull'isotopo nella nostra coorte di pazienti PA per determinare l'impatto sulla sintesi proteica, e risposte al metabolita plasmatico.
  2. Determinare l'impatto dell'uso del naturale (intatto) vs formula (cibo medico) proteina su antropometrica, risultati biochimici e clinici attraverso uno studio retrospettivo di storia naturale su pazienti con PA trattati all'ospedale pediatrico BC.

Le recenti linee guida dietetiche per la PA stanno scoraggiando la dipendenza dagli alimenti medici come unica fonte dietetica. Tuttavia, la maggior parte delle persone con PA sono a rischio di malnutrizione e dipendono da questi alimenti medici come fonte di energia e proteine ​​facilmente tollerabile. così, la determinazione del rapporto ottimale di BCAA negli alimenti medici PA è necessaria per ottimizzare la sintesi proteica, promuovere l'anabolismo, crescita e prevenire l'accumulo di metaboliti tossici.

Il nostro laboratorio, equipaggiato con l'uso di nuovi traccianti isotopici stabili per esaminare il metabolismo di proteine ​​e aminoacidi, è ideale per affrontare la questione del rapporto BCAA ideale da utilizzare per la gestione dietetica della PA e potenzialmente avere un impatto sugli esiti sanitari.

 

Le linee guida nutrizionali per l'acidemia propionica sono ora pubblicate

Grandi notizie - Sono ora pubblicate le "Linee guida nutrizionali per l'acidemia propionica"!

Il Comitato per le linee guida nutrizionali è lieto di annunciare che il gruppo di lavoro sull'acidemia organica ha pubblicato il documento "Acidemia propionica (PUNTELLO) Linee guida nutrizionali ”nel mese di febbraio, 2019 problema di Genetica molecolare e metabolismo. L'articolo è disponibile e può essere scaricato gratuitamente a https://doi.org/10.1016/j.ymgme.2019.02.007.

Pubblicazione delle linee guida nutrizionali PROP / PA in Genetica molecolare e metabolismo porta le ultime prove- e raccomandazioni sulla gestione della nutrizione basate sul consenso all'attenzione dei medici, researchers, decisori politici, assicuratori, e pazienti.

Il nuovo Forniscono linee guida per la gestione della nutrizione per PROP / PA:

  • Nuove direzioni comprese:
    • Una maggiore enfasi sui bisogni nutrizionali come l'assunzione di nutrienti, interventi nutrizionali, integrazione, ecc.
    • Meno enfasi sulla gestione medica che è stata trattata in pubblicazioni precedenti;
    • Argomenti aggiuntivi come il monitoraggio per garantire l'adeguatezza nutrizionale, problemi nutrizionali con gravidanza e allattamento, gestione nutrizionale per complicanze secondarie come la pancreatite, e infine una sezione che affronta il trapianto di fegato e la gestione nutrizionale prima, during, e dopo la procedura.

 

Due pezzi orientati al consumatore, Frequently Asked Questions and a Riepilogo del consumatore, fornire ai pazienti e alle famiglie le informazioni da utilizzare quando interagiscono con i loro fornitori. Il riepilogo evidenzia le raccomandazioni chiave e suggerisce domande che i pazienti e le famiglie potrebbero voler discutere con il team metabolico.

  • Quando i pazienti e gli operatori sanitari (HCP) avere le stesse informazioni, possono lavorare insieme come una squadra per identificare il trattamento migliore per la situazione del paziente.
  • Puoi accedere a questi pezzi al Genetic Metabolic Dietitians International (GM) o siti web di Southeast Genetics Network situati in http://www.Southeastgeneticsnetwork.org/ngp e http://www.GMDI.org
  • Le nuove linee guida dovrebbero portare a una maggiore coerenza dell'assistenza tra i centri.
    • Ci sono diverse importanti risorse incluse nelle linee guida, comprese le assunzioni di nutrienti raccomandate, programmi di monitoraggio, e tabelle degli interventi nutrizionali.
    • È disponibile un sito Web che fornisce tutte le risorse e i riferimenti utilizzati per sviluppare le linee guida in modo che i medici e gli altri possano ottenere prontamente le informazioni di base relative alle linee guida sui siti Web sopra elencati.
    • Il metodo di sviluppo delle linee guida ha utilizzato prove dalla ricerca pubblicata, letteratura medica basata sulla pratica e processi di consenso degli esperti.

Propionico Acidemia Foundation Research Grant – Richard

PAF Awards $33,082.12 Assegno di ricerca in 2019

PAF Awards $30,591 Continuation Grant in 2020

Eva Richard, Dottorato di Ricerca, Universidad Autonoma de Madrid, Spagna

“Cardiomiociti derivati ​​da cellule staminali pluripotenti indotte come un nuovo modello di sviluppo terapia in acidemia propionica”

La comprensione dei meccanismi cellulari e molecolari che si verificano nelle malattie genetiche è essenziale per la ricerca di nuove strategie per la loro prevenzione e trattamento. In questo contesto, cellule staminali pluripotenti indotte (IPSC) offrire opportunità senza precedenti per la modellazione di malattie umane. Uno dei poteri fondamentali della tecnologia COPSI sta nella competenza di queste cellule di essere diretto a diventare qualsiasi tipo di cellula del corpo, consentendo così ai ricercatori di esaminare meccanismi della malattia e identificare e testare nuove terapie in tipi cellulari pertinenti.

L'obiettivo principale di questo progetto è focalizzato sulla generazione di cardiomiociti COPSI derivate umane (hiPSC-CMS) da acidemia propionico (PA) pazienti come un nuovo modello cellulare umano per il disease.In PA, sintomi cardiaci, cioè disfunzione cardiaca e aritmie, sono stati riconosciuti come complicanze ad insorgenza tardiva progressive con conseguente una delle principali cause di mortalità per malattia. Utilizzando hiPSC-CM studieremo processi cellulari, come ad esempio la funzione mitocondriale e lo stress ossidativo, che sono stati riconosciuti come contributori principali per PA fisiopatologia. Inoltre, il nostro scopo è quello di svelare nuovi percorsi modificati con tecniche ad alta produttività come RNA-Seq e analisi miRNA. Esamineremo anche i potenziali effetti benefici di un antiossidante e un attivatore di biogenesi mitocondriale in cardiomiociti PA. I risultati che derivano da questo progetto saranno rilevanti per la malattia permettono di approfondire i processi biologici coinvolti, e quindi fornire strumenti e modelli per l'identificazione di nuovi trattamenti adiuvanti per PA.

Aggiorna aprile 2020 – Eva Richard PhD

Grazie all'acidemia propionica (PA) fondazione, abbiamo sviluppato un nuovo modello cellulare di PA basato su cellule staminali pluripotenti indotte (IPSC) con l'obiettivo di definire nuovi patomeccanismi della PA che potrebbero essere potenziali bersagli terapeutici. tradizionalmente, malattia fisiopatologia è stato studiato in linee cellulari immortalizzate o umani e in modelli animali. Unfortunately, le cellule immortalate spesso non rispondono poiché le cellule primarie ei modelli animali non ricapitolano esattamente i sintomi clinici dei pazienti. So far, pazienti-derivati ​​fibroblasti sono stati utilizzati principalmente come modelli cellulari in PA per la loro disponibilità e robustezza, ma hanno limitazioni importanti. La possibilità di riprogrammare le cellule somatiche per iPSCs ha rivoluzionato il modo di modellare malattie umane. Per studiare le malattie rare,
modelli di cellule staminali portatori di mutazioni specifiche del paziente sono diventati molto importante in quanto tutti i tipi di cellule possono essere differenziate dalle iPSCs.

Abbiamo generato e caratterizzato due linee iPSC da fibroblasti derivati ​​da pazienti con difetti nei geni PCCA e PCCB; e un controllo isogenico in cui la mutazione del paziente PCCB è stata geneticamente corretta utilizzando la tecnologia CRISPR / Cas9. Queste linee iPSC sono state differenziate con successo in cardiomiociti,
e la loro presenza è stata facilmente stabilita dall'osservazione visiva di regioni in contrazione spontanea e dall'espressione di diversi marker cardiaci. I cardiomiociti derivati ​​da PCCA iPSC hanno mostrato un ridotto consumo di ossigeno, un accumulo di corpi residui e goccioline lipidiche, e una maggiore biogenesi ribosomiale. Inoltre, abbiamo riscontrato un aumento dei livelli proteici di HERP, GRP78, GRP75, Suggerendo SIG-1R e MFN2
stress del reticolo endoplasmatico e perturbazioni del calcio in queste cellule. Abbiamo anche analizzato una serie di miRNA arricchiti di cuore precedentemente trovati deregolamentati nel tessuto cardiaco di un modello murino PA e confermato la loro espressione alterata.

Il presente studio rappresenta il primo rapporto sulla caratterizzazione dei cardiomiociti derivati ​​da iPSC generati dalla riprogrammazione dei fibroblasti dei pazienti con PA. I nostri risultati forniscono la prova che diversi meccanismi patologici possono avere un ruolo rilevante nella disfunzione cardiaca, una complicanza comune nella malattia di PA. Questo nuovo modello di PA cellulare offre un potente strumento per svelare il meccanismo della malattia e, potenzialmente, per abilitare la droga
screening / test antidroga. Nonostante il miglioramento della terapia negli ultimi decenni, l'esito dei pazienti con PA è ancora insoddisfacente, evidenziando l'esigenza di valutare nuove terapie volte a prevenire o alleviare i sintomi clinici. Sono necessarie ulteriori ricerche per determinare il contributo dei meccanismi identificati in questo lavoro al fenotipo cardiaco e come questa conoscenza possa aiutare a formulare una terapia terapeutica più personalizzata
strategie future.

Ringraziamo sinceramente la Propionic Acidemia Foundation per il supporto della nostra indagine, che si è tradotta in un'esperienza davvero motivante per noi, sentendo di appartenere alla famiglia di ricercatori della PA. Il finanziamento che abbiamo ricevuto ha portato a importanti progressi nella fisiopatologia della PA, e il nostro obiettivo è continuare questa ricerca nel prossimo futuro.

aggiornamento di settembre 2019 – Eva Richard PhD

V'è una necessità clinica insoddisfatta di sviluppare terapie efficaci per acidemia propionico (PA). I progressi nella terapia di supporto a base di restrizione dietetica e la supplementazione di carnitina hanno permesso ai pazienti di vivere oltre il periodo neonatale. Tuttavia, il risultato globale rimane scarsa nella maggior parte dei pazienti, che soffrono di numerose complicazioni legate alla progressione della malattia, Tra questi alterazioni cardiache, una delle principali cause di morbilità e mortalità PA. In our research, abbiamo sviluppato un nuovo modello di cellulare di PA a base di cellule staminali pluripotenti indotte (IPSC) con l'obiettivo di definire nuovi percorsi molecolari coinvolti nella fisiopatologia della PA, che sarebbe potenziale trattamento mira.

tradizionalmente, malattia fisiopatologia è stato studiato in linee cellulari immortalizzate o umani e in modelli animali. Unfortunately, immortalizedcells spesso non rispondono celle come primario e modelli animali non esattamente ricapitolano i sintomi dei pazienti. So far, I pazienti ad derivati ​​fibroblasti sono stati modelli cellulari principalmente utilizzato così come in PAdue a theiravailability e robustezza, ma hanno limitazioni importanti.

La possibilità di riprogrammare le cellule somatiche per iPSCs ha rivoluzionato il modo di modellare malattie umane. Per studiare le malattie rare, modelli di cellule staminali portatori di mutazioni specifiche del paziente sono diventati molto importante in quanto tutti i tipi di cellule possono essere differenziate dalle iPSCs. Abbiamo generato e caratterizzato due linee IPSC da fibroblasti di pazienti-derivati ​​con difetti PCCA e PCCB genes. Queste linee IPSC possono essere differenziati in cardiomiociti che imitano le caratteristiche tessuto-specifici della malattia. La presenza di cardiomiociti PA è facilmente stabilita mediante osservazione visiva delle regioni spontaneamente amministrazioni, e l'espressione di diversi marcatori cardiaci. Abbiamo osservato che i cardiomiociti PCCA-deficienti presentano un incremento dei prodotti di degradazione e di gocce lipidiche, e presentano disfunzione mitocondriale rispetto alle cellule di controllo. Abbiamo scoperto ulteriormente la down-regolazione di diversi miRNA in cardiomiociti PCCA rispetto ai controlli quelle, e più bersagli miRNA sono attualmente oggetto di analisi per indagare sottostanti meccanismi patologici cellulari. Interestingly, abbiamo effettuato diversi esperimenti per analizzare l'effetto dell'attivatore biogenesi mitocondriale, composto MIN-102 (PPAR agonisti, derivato di pioglitazone) in cardiomiociti.

I risultati preliminari hanno mostrato un aumento nelle cellule PCCA e di controllo del consumo di ossigeno rateof. In our next steps, abbiamo in programma di completare l'analisi della linea cardiomiociti PCCA, caratterizzare cardiomiociti PCCB e approfondire il potenziale terapeutico di MitoQ e MIN-102 composti.

We would like to sincerely thank the Propionic Acidemia Foundation for supporting our research.

Aggiornamento marzo 2020

"I cardiomiociti derivati ​​da cellule staminali pluripotenti indotte come nuovo modello per lo sviluppo della terapia nell'acidemia propionica."

Eva Richard, Associate Professor

V'è una necessità clinica insoddisfatta di sviluppare terapie efficaci per acidemia propionico (PA). I progressi nella terapia di supporto a base di restrizione dietetica e la supplementazione di carnitina hanno permesso ai pazienti di vivere oltre il periodo neonatale. Tuttavia, il risultato globale rimane scarsa nella maggior parte dei pazienti, che soffrono di numerose complicazioni legate alla progressione della malattia, Tra questi alterazioni cardiache, una delle principali cause di morbilità e mortalità PA. In our research, abbiamo sviluppato un nuovo modello di cellulare di PA a base di cellule staminali pluripotenti indotte (IPSC) con l'obiettivo di definire nuovi percorsi molecolari coinvolti nella fisiopatologia della PA che potrebbero essere potenziali bersagli terapeutici.

tradizionalmente, malattia fisiopatologia è stato studiato in linee cellulari immortalizzate o umani e in modelli animali. Unfortunately, cellule immortalizzate spesso non rispondono come pile e modelli animali Non esattamente i sintomi dei pazienti ricapitolare. So far, pazienti-derivati ​​fibroblasti sono stati utilizzati principalmente come modelli cellulari in PA per la loro disponibilità e robustezza, ma hanno limitazioni importanti.

La possibilità di riprogrammare le cellule somatiche per iPSCs ha rivoluzionato il modo di modellare malattie umane. Per studiare le malattie rare, modelli di cellule staminali portatori di mutazioni specifiche del paziente sono diventati molto importante in quanto tutti i tipi di cellule possono essere differenziate dalle iPSCs. Abbiamo generato e caratterizzato due linee IPSC da fibroblasti pazienti-derivati ​​con difetti nel PCCA e PCCB genes. Queste linee IPSC possono essere differenziati in cardiomiociti che imitano le caratteristiche tessuto-specifici della malattia. La presenza di cardiomiociti è stata facilmente stabilita mediante osservazione visiva delle regioni contraenti spontaneamente, e l'espressione di diversi marcatori cardiaci. cardiomiociti PCCA COPSI-derivati ​​presentavano un'alterazione del processo autofagia con un accumulo di corpi residui e disfunzione mitocondriale caratterizzati da un ridotto consumo di ossigeno e l'alterazione della biogenesi mitocondriale causa di una deregolazione di PPARGC1A. Abbiamo inoltre valutato l'espressione dei miRNA cuore arricchita precedentemente associati con disfunzione cardiaca e diversi miRNA hanno trovato deregolata. Inoltre, abbiamo trovato un aumento di livelli di proteina Herp, GRP78, Grp75, sigma-1R e MFN2 suggerendo ER stress e di calcio perturbazioni in queste cellule.

Stiamo progettando di analizzare i cardiomiociti PCCB per confrontare i risultati con PCCA e controllare i dati. Stiamo lavorando per ottenere cardiomiociti maturi al fine di eseguire studi di elettrofisiologia (correnti K +) utilizzando un metodo patch clamp whole-cell. Siamo interessati allo studio delle bioenergetiche firma confrontando cardiomiociti tessuto-specifiche derivate dal controllo e iPSCs PA patients' da microarrays della proteina fase inversa (RPPMA). futuro lavoro comprende anche testare l'effetto dell'attivatore mitocondriogenesi, composto MIN-102 (PPAR agonisti, derivato di pioglitazone) e del bersaglio mitocondriale antiossidante MitoQ in cardiomiociti PA.

We would like to sincerely thank the Propionic Acidemia Foundation for supporting our research.

 

 

 

Propionico Acidemia Foundation Research Grant Guofang Zhang

PAF Awards $48,500 Research Grant

Guofang Zhang, Dottorato di Ricerca, Duke University

“Propionil-CoA e propionylcarnitine mediare complicanze cardiache in pazienti con acidemia propionico”

La produzione di energia è il metabolismo cardiaco centrale per lavoro meccanico continuo. Un cuore adulto medio consuma umana ~ 6 kg ATP / giorno. stoccaggio ATP nel cuore è sufficiente solo per sostenere il battito cardiaco per alcuni secondi. Una strettamente accoppiati metabolismo energetico cardiaco da vari substrati è critica per la produzione di ATP sufficiente richiesto dalla funzione cardiaca normale.

Una molecola di acido palmitico (acido grasso) genera molto più ATP di una molecola di glucosio fa dopo che i loro acidi completi metabolism.Fatty contribuiscono ~ 70-90% la produzione di energia cardiaca in condizioni normali. Tuttavia, cuore mantiene ancora elevata flessibilità di sostituzione di combustibili in risposta a vari substrati disponibili. Acetil-CoA è il primo metabolita convergente derivato dai diversi substrati combustibile attraverso percorsi diversi e entra nel ciclo dell'acido tricarbossilico (TCAC) per la produzione di energia. Dunque, il livello di acetil-CoA o il rapporto di acetil-CoA / CoA controlla strettamente i flussi metabolici di due combustibili principali, cioè, il glucosio e acido grasso, nel cuore. Livello CoA acetil-CoA o è anche finemente sintonizzato da carnitina acetiltransferasi (CRATER) che catalizza l'interconversione reversibile tra catena corta acil-CoA e acylcarnitines.Acetylcarnitine livello è ~ 10-100 volte superiore a quella di acetil-CoA nel cuore e è visto come il buffer di acetil-CoA. Crat è altamente espresso in organi alta energia esigenti compresi cuore e media acidi grassi e il metabolismo del glucosio eventualmente interconversione dinamicamente acetil-CoA e dell'acetilcarnitina in ciascuna carenza other.The di crat ha dimostrato di modificare la selezione carburante cardiaco.

Propionico acidemia (PA) è spesso associata a complicanze cardiache. Tuttavia, il meccanismo patologico rimane sconosciuta. Abbiamo dimostrato che l'alta propionato esogeno portato all'accumulo propionil-CoA e interruttore carburante cardiaco da acidi grassi in glucosio normali cuori di ratto perfusi (am. J Physiol. Endocrinol. Metab., 2018.315:E622-E633). Il deficit di propionil-CoA carbossilasi in PA induce anche l'accumulo di propionil-CoA. Successivo, si cercherà di capire se e come l'elevata propionil-CoA nel PCCA-/- cuore (collaborazione con il Dott. Michael Barry)potrebbe interrompere il metabolismo energetico cardiaco studiando la flessibilità interruttore carburante, Crat metabolismo mediato, e tampone capacità di acetilcarnitina utilizzando stabile analisi flusso metabolico isotopo basata (J. Biol. Chem., 2015,290:8121-32). Ci auguriamo che l'esito di questo progetto fornirà raccomandazione terapeutico significativo per i pazienti con PA, in particolare con la complicazione cardiaca.

Novel therapies for Propionic acidemia – update Sept. 2018

Novel therapies for Propionic acidemia

Nicola Brunetti-Pierri, MD, Fondazione Telethon, Italy

This proposal was focused on the characterization of a fish model of propionic acidemia (PA) and on the development of novel therapies. The PA medaka fish model was found to recapitulate several clinical and biochemical features of the human disease, including reduced survival and locomotor activity, hepatic lipid accumulation, increased propionylcarnitine, methylcitrate, and propionate. Moreover, PA fishes showed better survival when fed with low-protein diet.

To gain insight into the disease pathogenesis and to search for potentially novel therapeutic targets, we performed an unbiased 3’-mRNA-Seq and NMR-based metabolome analyses. Both analyses showed global differences between PA and wild-type (wt) medaka. Interestingly, metabolism of glycine and serine resulted affected both at transcriptional and metabolites level and further studies are ongoing to investigate the role of these changes in the disease pathogenesis. Moreover, we found a marked increase in protein propionylation in PA fishes compared to wt controls. Protein propionylation is a post-translational modification occurring under normal conditions but its physiological role is unknown. Like protein acetylation, it is likely involved in regulation of gene expression, protein-protein interactions, and enzyme function. Interestingly, NAD-dependent sirtuins that are responsible of deacetylation of multiple proteins and have also de-propionylating activity, were significantly reduced in PA fishes. We speculated that aberrant protein propionylation in PA is toxic and proteomic studies are ongoing to reveal proteins with aberrant propionylation. With the support of this grant several drug candidates have been also investigated with the goal of developing new pharmacological approaches for PA.

In conclusion, we performed extensive phenotyping of the PA fish model that can be useful to unravel novel disease mechanisms and therapeutic targets.

aggiornato settembre 2018

PAF Awards grant for Dr. Oleg Shchelochkov and Dr. Charles P. Venditti for $32,912

PAF assegnato un $32,912 research grant to Oleg Shchelochkov, M.d. and Charles P. Venditti MD, PhD at National Human Genome Research Institute, National Institutes of Health – 2018

“Diversion of Isoleucine and Valine Oxidative Pathway to Reduce the Propionogenic Load in Propionic Acidemia.”

Patients with propionic acidemia require lifelong protein restriction. In addition to taking a protein restricted diet, many propionic acidemia patients are also prescribed medical formulas. This dietary approach aims to decrease the intake of four amino acids that can become propionic acid. These four amino acids – isoleucina, valina, threonine, and methionine – are called essential, because they cannot be made in the human body and need to be supplied from foods. Too much protein intake creates a situation where excess can lead to a buildup of propionic acid in the body. On the other hand, limiting these four amino acids too much can lead to poor growth. Dunque, patients’ diets are optimized to minimize propionic acid production while encouraging good growth. We wonder whether it is possible to increase dietary protein intake while minimizing the risk of propionic acid buildup.

To answer this question, we are planning to do a series of experiments in zebrafish. Why use zebrafish? Zebrafish share significant similarity to humans in how they process propionic acid. Inoltre, zebrafish reproduce and mature quickly, which are very important qualities to help search for new drugs that could be used to treat propionic acidemia. Our zebrafish are kept in a special building where the animals are being cared for by a dedicated team that includes scientists, veterinarians, engineers, aquatic specialists, and many others. They check on fish and feed them several times a day, maintain fish tanks, and keep their water very clean.

This type of facility is unique and had enabled our studies of metabolic diseases in zebrafish. Our ongoing studies have shown that zebrafish affected by metabolic diseases have symptoms that are very similar to patients. Even with treatment, affected fish have difficulty growing, get tired easily, have poor appetites and sometimes perish before adulthood. Using special genomic tools, we are planning to change in how the fish processes protein to direct it away from becoming propionic acid. As we make these changes to the biochemical pathways of propionic acidemia zebrafish, we will be carefully watching how these treatments improve their growth, development, appetite and survival. These experiments will help us understand how we can potentially reduce propionic acid toxicity while helping patients achieve a less restrictive diet.

Intervista a Joel Pardo – Summer 2020

Puoi parlarmi di te e di come ti sei interessato alla scienza?

Sono sempre stato interessato alle scienze. Penso che alla fine ciò che mi ha spinto verso una carriera nella scienza sia stata la mia esperienza di ricerca presso l'Università della California, San Diego. Il tutoraggio che ho ricevuto dal dott. Joshua Bloomekatz mi ha aiutato a sviluppare la capacità di ragionare scientificamente e ad apprezzare le opportunità di crescita professionale. Da lui ho imparato come progettare esperimenti per rispondere a importanti domande scientifiche. Abbiamo avuto spesso lunghe discussioni sulla direzione del mio progetto. Mi ha aiutato a dare un senso alla raccolta di osservazioni provenienti da diverse fonti e ha coltivato il mio pensiero indipendente., Ho cominciato a vedere me stesso come un giorno che contribuisce al pensiero scientifico come medico-scienziato.

Durante la tua formazione presso NIH, hai lavorato a un progetto per trovare nuovi trattamenti usando il pesce zebra. Cosa hai trovato eccitante e stimolante nello studio del pesce zebra?

La maggior parte delle persone ha familiarità con i topi, che sono spesso usati nella scienza per trovare e testare nuovi farmaci. Lavorare con i topi richiede molto lavoro per avere abbastanza animali necessari per un esperimento. Pesce zebra, d'altro canto, può produrre centinaia di prole dopo un ciclo di riproduzione. Il pesce zebra depone le uova direttamente nell'acqua, il che rende anche più facile studiarli subito dopo la schiusa. Un po 'sorprendentemente,gli enzimi del pesce zebra che gestiscono l'acido propionico sono molto simili agli enzimi negli esseri umani. Queste due proprietà del pesce zebra lo rendono un modello interessante per studiare una malattia come l'acidemia propionica.

Una delle parti più impegnative della mia ricerca sul pesce zebra è stata la loro dimensione. La prole del pesce zebra è molto piccola, misura meno di un quarto di pollice. Ho dovuto passare molto tempo a guardare i pesci zebra al microscopio e imparare a spostarli senza ferirli. Questo può essere difficile in quanto questi piccoli animali sono fragili in questa giovane età.

Puoi parlarci del tuo progetto PA?

In precedenza nel mio lavoro, siamo riusciti a prendere il pesce zebra, che presentava mutazioni nei geni legati all'acidemia propionica. Avevo bisogno di capire cosa fa l'acidemia propionica al pesce zebra. Siamo stati in grado di dimostrare che l'acidemia propionica nel pesce zebra assomiglia molto alla malattia che vediamo nei pazienti. I pesci con acidemia propionica avevano scarso appetito, non è cresciuto bene, e aveva difficoltà a muoversi. Utilizzando strumenti genetici speciali, abbiamo quindi tentato di cambiare il modo in cui i pesci zebra elaboravano l'acido propionico e li aiutavano a sopravvivere più a lungo. I nostri risultati preliminari si stanno dimostrando promettenti, ma è ancora necessario altro lavoro.

Quali sono i tuoi piani dopo aver completato la tua formazione presso NIH?

Il programma NIH postbac è un premio di ricerca a tempo pieno per studenti che hanno recentemente completato una laurea e stanno valutando una carriera nel campo della scienza o della medicina. Ho avuto la fortuna di unirmi al dott. Il laboratorio di Charles Venditti 2 anni fa per lavorare al progetto zebrafish sotto il dott. Oleg Shchelochkov. Ho apprezzato molto la mia esperienza post-bac. Guardando indietro al passato 2 years, Sento il laboratorio, e in particolare il tutoraggio del dott. Shchelochkov, ha facilitato e alimentato la mia crescita come futuro medico-scienziato con radici nella ricerca sull'acidemia propionica. In 2019 Ho fatto domanda per programmi di MD / PhD in diverse università statunitensi. Dopo aver viaggiato in più di una mezza dozzina di stati e aver sostenuto colloqui in molte fantastiche università, Alla fine ho deciso il programma di formazione per medico-scienziato presso l'Università del Minnesota. Mentre pianifico la mia transizione al programma, Attualmente sto cercando cappotti invernali.